可复现分析 Notebook

原始文件名notebook-public.ipynb

公开 Notebook · IPYNB2.0 KB脱敏后公开

内容说明: 提供公开副本的 Notebook JSON，用于查看分析步骤、固定记录和评价上下文；站内只展示安全 JSON 文本，不执行单元格。
能够证明: 支持项目保存了可供下载复核的公开 Notebook 副本。
不能证明: 不证明本页面执行过 Notebook、不证明环境可复现成功或产生新的实验结果。
许可说明: CC BY 4.0 国际署名许可（公开分析叙述）；Notebook 所用原始数据另受 ODC Attribution 1.0
来源和脱敏说明: 来自 MIT-BIH 公开派生包的公开 Notebook 副本；本 Goal 严禁执行 Notebook。

预览

站内查看方式

最多显示 100 KB 的安全 JSON 文本；完整内容请下载后用 Jupyter 查看。

该 Notebook 为公开副本，以下只显示不超过 100 KB 的安全 JSON 文本；页面不执行 Notebook。

{
  "cells": [
    {
      "cell_type": "markdown",
      "source": [
        "# MIT-BIH 小样本实验自动执行入口\n",
        "\n",
        "该 Notebook 只调用已测试的新实验模块，不复制算法。输入限于本 Goal 已完成 SHA-256 核验的 100、105、118、119 记录。主指标覆盖完整记录。\n",
        "\n",
        "本项目仅供教学、实验和辅助分析，不可替代医生诊断。"
      ]
    },
    {
      "cell_type": "code",
      "execution_count": null,
      "outputs": [],
      "source": [
        "from pathlib import Path\n",
        "import sys\n",
        "\n",
        "START = Path.cwd().resolve()\n",
        "ROOT = next(path for path in (START, *START.parents) if (path / 'experiments/mitbih-small-sample').exists())\n",
        "EXP_ROOT = ROOT / 'experiments/mitbih-small-sample'\n",
        "sys.path.insert(0, str(EXP_ROOT / 'src'))\n",
        "print('Repository root:', ROOT)\n",
        "print('Experiment root:', EXP_ROOT)"
      ]
    },
    {
      "cell_type": "code",
      "execution_count": null,
      "outputs": [],
      "source": [
        "from run_build import setup_logger, run_experiment\n",
        "\n",
        "logger, notebook_log = setup_logger()\n",
        "result = run_experiment(logger)\n",
        "print('Notebook log:', notebook_log)\n",
        "result['summary']"
      ]
    },
    {
      "cell_type": "code",
      "execution_count": null,
      "outputs": [],
      "source": [
        "required = [\n",
        "    EXP_ROOT / 'outputs/csv/per_record_metrics.csv',\n",
        "    EXP_ROOT / 'outputs/csv/summary_metrics.csv',\n",
        "    EXP_ROOT / 'outputs/csv/match_ledger.csv',\n",
        "] + [EXP_ROOT / f'outputs/figures/overview_{record}.png' for record in ('100','105','118','119')]\n",
        "missing = [str(path) for path in required if not path.exists()]\n",
        "assert not missing, missing\n",
        "print('PASS: all required Notebook-verified outputs exist')"
      ]
    }
  ],
  "metadata": {
    "kernelspec": {
      "display_name": "Python 3",
      "language": "python",
      "name": "python3"
    },
    "language_info": {
      "name": "python"
    }
  },
  "nbformat": 4,
  "nbformat_minor": 5
}

公开包完整性

SHA-256 摘要

23f767fd65c18bb2d7fdac3b64fa6e7915fec15032244057c9914477d96168a8

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